पांढर्‍या चंदनापेक्षा लाल चंदनाचे झाड वाढण्यास जास्त वर्षे लागतात . त्यामुळे पांढऱ्यापेक्षा लाल जातीचा पुरवठा खूपच कमी आहे. दुसरा फरक म्हणजे लाल चंदनात पांढर्‍या लगद्याचे सुगंधी गुणधर्म नसतात. तथापि, दोन्ही चंदनामध्ये समान औषधी गुणधर्म आहेत आणि ते पर्यायी औषधांमध्ये वापरले जातात.